2. Najděte tajné umístění základny. V celém Sinnohu je mnoho různých tajných základn. Mezi nejoblíbenější místa patří:
* Malý ostrov na Route 218
* Jeskyně poblíž vchodu do Ztracené věže na Route 213
* Dům v Pastoria City, který je ve výstavbě
3. Použijte Secret Base Kit. Jakmile najdete umístění tajné základny, vytvořte si základnu pomocí sady Secret Base Kit. Můžete si vybrat typ základny, kterou chcete vytvořit, a také ji ozdobit nábytkem a dalšími předměty.
4. Naverbujte členy týmu. Můžete naverbovat další hráče, aby se připojili k vašemu tajnému základnímu týmu. Chcete-li to provést, promluvte si s osobou, kterou chcete naverbovat, a vyberte možnost „Naverbovat“.
5. Bojujte s ostatními týmy. S tajnými základnami jiných týmů můžete bojovat tak, že si promluvíte s osobou u vchodu do základny a vyberete možnost „Bitva“. Tajné základní bitvy jsou bitvy 2 na 2 a vítězem je tým, který jako první vyřadí oba soupeřovy pokémony.
6. Získej body a odměny. Body můžete získávat vyhráváním tajných bitev na základně a plněním tajných misí na základně. Body můžete použít k nákupu předmětů z obchodu Secret Base Shop a také je můžete použít k vylepšení své tajné základny.