* Thomas a jeho přátelé Minho, Newt a Teresa konečně uniknou z obávaného Bludiště.
* Dozvědí se pravdu o svém skutečném účelu:sloužit jako subjekty v krutém experimentu prováděném WCKD, organizací, která vytvořila a kontrolovala Bludiště.
* Teresa prozradí svou věrnost WCKD, čímž Thomase zlomí srdce a bude se ptát, komu může věřit.
* Skupina, nyní uprchlíci, se vydává na nebezpečnou cestu přes Scorch, pustou a zrádnou pustinu, při hledání bájného Bezpečného přístavu, místa, kde se mohou osvobodit ze spárů WCKD.
* Cestou čelí mnoha výzvám, včetně nemilosrdných Cranků, prudkých bouří a všudypřítomné hrozby ze strany Stvořitelů.
* Nakonec se dostanou do Safe Haven, jen aby zjistili, že to není to, v co doufali. Je to dočasné útočiště, ovládané jinou frakcí, která se je také snaží využít pro své vlastní účely.
* Thomas, Minho a Newt se dozví pravdu o Flare, smrtelné nemoci, která zpustošila svět. Uvědomují si, že mají klíč k nalezení léku díky své jedinečné imunitě.
* S nově nalezeným odhodláním se rozhodnou čelit WCKD a jednou provždy ukončit svou hrůzovládu. Vydávají se na poslední misi, infiltrují velitelství WCKD, aby odhalili tajemství organizace a osvobodili ty, kteří byli uvězněni a na kterých se experimentovalo.
* V klimatické bitvě Thomas a jeho přátelé překonávají četné překážky, čelí svým nejhlubším obavám a obětují vše pro větší dobro lidstva.
* Nakonec se jim podaří ve svém poslání svrhnout WCKD a zajistit budoucnost, kde lidé budou moci žít bez spárů manipulace a útlaku.