Groudon (Pozemní typ)
* Nalezeno v Cave of Origin poté, co porazil Elite Four a stal se šampionem.
* Může být zajat pouze po získání červené koule.
Kyogre (vodní typ)
* Nalezeno v Cave of Origin poté, co porazil Elite Four a stal se šampionem.
* Lze zajmout pouze po získání Modré koule.
Rayquaza (typ draka/létání)
* Nalezeno v Sky Pillar poté, co Groudon a Kyogre jsou poraženi.
* Lze zajmout pouze po získání červené koule a modré koule.
Regirock (rockový typ)
* Nachází se ve starověkém chrámu v poušti, přístupný po získání tří klíčů Regi.
* Musíte aktivovat chrám pomocí klíčů v určitém pořadí.
Regice (typ ledu)
* Nachází se ve starověkém chrámu v poušti, přístupný po získání tří klíčů Regi.
* Chrám musíte aktivovat pomocí klíčů v určitém pořadí.
Registeel (typ oceli)
* Nachází se ve starověkém chrámu v poušti, přístupný po získání tří klíčů Regi.
* Chrám musíte aktivovat pomocí klíčů v určitém pořadí.
Latias (typ drak/psychický typ)
* Nalezeno na Jižním ostrově po získání Eon flétny.
* Dostupné pouze po získání Eon Flute.
Latios (Dragon/Psychický typ)
* Nalezeno na Jižním ostrově po získání Eon flétny.
* Dostupné pouze po získání Eon Flute.
Jirachi (ocelový/psychický typ)
* Nalezeno v Domě Wishmakera po získání Hvězdného kamene.
* Toto je vzácné setkání a k jeho probuzení budete muset použít Hvězdný kámen.
Mňau (psychický typ)
* Technicky nelze získat normálním hraním. K získání vyžaduje závadu nebo cheatové zařízení.
Poznámka: Zatímco můžete technicky získat Mewtwo v Pokémon Emerald to není legendární setkání. To lze nalézt v opuštěném Pokémon Mansion v oblasti Slateport City.