Byla nalezena mrtvá ve své kanceláři v newyorské Greenwich Village. Její smrt byla označena za vraždu v důsledku ručního uškrcení a tupého poranění hlavy .
Případ byl původně považován za možnou sebevraždu, ale následné vyšetřování ukázalo, že Shelly byla zavražděna stavebním dělníkem jménem Diego Pillco .
Pillco, který pracoval na budově, kde se nacházela Shellyina kancelář, se k činu přiznal a byl odsouzen ze zabití .
Shellyina smrt byla pro filmový průmysl tragickou ztrátou a její odkaz nadále inspiruje začínající filmaře.