Vražda v Orient Expressu se ponoří do tématu identity a její složitosti. Román představuje několik postav s různými původy, kulturami a programy, z nichž každá skrývá skrytou identitu nebo nese tajemství. Detektiv Poirot se musí podívat za povrch, aby zjistil skutečné charaktery a motivace cestujících.
Významnou roli v příběhu hraje i téma spravedlnosti. Poirot usiluje nejen o vyřešení zločinu, ale také o zajištění spravedlnosti. Cestující čelí etickému dilematu, když se spojí, aby rozhodli o vrahově osudu. Musí se rozhodnout, zda budou dodržovat přísné právní postupy, nebo vzít věci do vlastních rukou, aby dosáhli pocitu spravedlnosti, který je podle nich nezbytný.
Román vyvolává zajímavé otázky o složitosti lidské identity, nejednoznačnosti morálky a hledání pravdy a spravedlnosti.