- "Proč kříž?" (1901) :
Toto je jeho nejznámější dílo, které představuje teologické zdůvodnění ukřižování Ježíše Krista a to, jak to znamená Boží lásku a milost.
- „Bojiště duše:Studie vědy o posvěcení“ (1903) :
Tato kniha zkoumá duchovní cestu křesťana a to, jak by věřící měli usilovat o osobní svatost a vítězství ve svých vnitřních zápasech.
– „Tajemství šťastného dne“ (1904) :
Tato kniha si klade za cíl inspirovat jednotlivce, aby našli štěstí a spokojenost tím, že se přiblíží k Bohu a přijmou život s duchovní proměnou.
- „Život, který vítězí“ (1906) :
Tato práce zdůrazňuje důležitost životaschopného a vítězného křesťanského života a zdůrazňuje potřebu pevné víry a důsledného odevzdání se do Boží vůle.
- "Klíč království" (1907) :
V této knize Johnstone vysvětluje učení Ježíše Krista a zdůrazňuje význam osobního učednictví a života podle Božích přikázání.
- „Jistá cesta spásy“ (1909) :
Tato práce poskytuje přímočaré a stručné vysvětlení toho, jak mohou jednotlivci získat spasení skrze víru v Ježíše Krista.
- „Velikost Boha“ (1919) :
Tato kniha se ponoří do Božího majestátu a svrchovanosti a zaměřuje se na Jeho vlastnosti a na to, jak ovlivňují lidské chápání a uctívání.
- "Kříž a jeho význam" (1930) :
Johnstone se vrací k významu Kristova ukřižování a objasňuje jeho mnohostranné důsledky pro lidskou spásu a smíření s Bohem.
Toto jsou některé z významných spisů Johna Chalmerse Johnstonea, které demonstrují jeho teologickou hloubku a duchovní dopad, který měl na četné čtenáře v průběhu let.