Séguy se narodil v Toulonu ve Francii 1. července 1877. Již v mladém věku projevil vášeň pro přírodopis a ve 12 letech začal sbírat hmyz. Studoval medicínu na univerzitě v Montpellier a promoval v roce 1902.
Séguy začal svou kariéru jako vojenský lékař, ale brzy se věnoval entomologii. Pracoval v Muséum national d'histoire naturelle v Paříži od roku 1906 až do svého odchodu do důchodu v roce 1942. Během svého působení v muzeu byl kurátorem sbírky Diptera a publikoval četné vědecké články a knihy na toto téma.
Séguyovou hlavní oblastí výzkumu byla čeleď Muscidae a stal se světovým expertem na tuto skupinu. Popsal více než 1000 nových druhů Muscidae a publikoval několik monografií a katalogů o rodině. Pracoval také na dalších rodinách Diptera, včetně Tephritidae, Conopidae a Cecidomyiidae.
Kromě své vědecké práce byl Séguy také aktivním členem několika vědeckých společností, včetně Société entomologique de France a Royal Entomological Society of London. V roce 1939 mu byla udělena Linneanova medaile Linnean Society of London a v roce 1949 Prix Constant od Académie des sciences v Paříži.
Séguy zemřel v Paříži 23. října 1951 ve věku 74 let. Byl to plodný entomolog, který významně přispěl ke studiu dvoukřídlých a jeho práce je dodnes široce citována vědci.