Hudební obřady jsou nedílnou součástí šintoistických obřadů a hudební nástroje jako bubny a flétny mají obrovský význam. Zejména bubny jsou považovány za posvátné a hrají se rytmicky, aby probudily emoce božstev a přitáhly je k obřadům.
Šintoistická hudba je různorodá a zahrnuje jak starověkou rituální hudbu, tak moderní úpravy, které zachovávají tradiční prvky. Slavnostní hudba Kagura je ztělesněním rituální hudby, kterou hrají kněží a kněžky během velkých festivalů. Gagaku, dvorský hudební žánr, spojuje původní japonské melodie s čínskými vlivy a hraje se při obřadech nejvyššího významu.
Vliv šintoistické hudby pronikl do dalších oblastí japonské kultury, včetně divadla Noh a lidových rituálů. Japonská hudba si zachovává úzké spojení s národními šintoistickými kořeny a hudební složky z těchto rituálů se nadále odrážejí v současných uměleckých postupech.