Když se špióni snaží přelstít jeden druhého, narazí na komické překážky, které z jejich špionáže udělají vedlejší show grotesky. Black Spy se zaplete do obřího yo-ya, zatímco White Spy zjistí, že ho pronásleduje roj gumových kuřat. Flóra a fauna ostrova se připojují k šílenství, mluvící papoušci se vysmívají každému pohybu špionů a zlomyslné opice kradou jejich tajné plány.
Uprostřed eskalujícího chaosu narazí dva špióni na skrytou podzemní laboratoř, kde objeví strůjce jejich nekonečného soupeření:zlomyslného MAD vědce jménem profesor Wacko. Ukáže se, že Wacko organizoval mise Spy vs Spy pro své vlastní pobavení pomocí dálkově ovládaných převleků a triků, aby špiony udržoval v pronásledování stínů.
Ve vrcholné scéně, která se vzpírá logice a rozumu, se Black Spy a White Spy spojí proti profesoru Wackovi a zapojí se do šílené bitvy, která zahrnuje pudinkové koláče, explodující doutníky a obří gumičku. Nakonec se špióni a vědec zapletou do spletitého zvratu událostí, z nichž se jim všem zatočí hlava a jsou zcela poraženi.
Když padá opona za dobrodružstvím Spy vs Spy, agenti se ocitnou zpět ve svém velitelství a přemítají, zda jejich poslední eskapáda nebyla jen divoká halucinace. S jejich typickými úsměvy pokrčí rameny a připravují se na svou další misi s vědomím, že svět Spy vs Spy bude vždy plný šílených překvapení a nepředvídatelných zvratů.