* Příroda a ekologie: Hundertwasser hluboce věřil ve vzájemné propojení lidí a přírody. Jeho umění často zobrazovalo svěží krajinu, stromy a zvířata, oslavující krásu a křehkost přírodního světa.
* Architektura: Architekturu viděl jako formu umění a věřil ve vytváření budov, které hladce splývají s přírodou, s křivkami, organickými tvary a spoustou zeleně. Jeho obrazy často představovaly fantastické, biomorfní budovy, zdůrazňující jeho vizi udržitelného a harmonického městského prostředí.
* Spirály a kruhy: Tyto opakující se motivy symbolizují organický růst, životní cykly a propojenost všech věcí. Používal je k vytvoření pocitu pohybu a energie ve svém uměleckém díle.
* Barva a textura: Hundertwasser miloval používání jasných, zářivých barev a kontrastních textur k vytváření vizuálně stimulujících a poutavých kompozic. K vyjádření pocitu pohybu a života často používal výrazné tahy a krouživé vzory.
* Antigeometrie a antiracionalita: Odmítl tradiční, rigidní geometrické formy a přijal krásu nepravidelnosti a spontánnosti, což odráželo jeho přesvědčení, že umění by mělo být osobním a intuitivním vyjádřením.
Kromě těchto témat začlenil Hundertwasser také prvky filosofie, spirituality a sociálního komentáře do své práce, často se zabývá tématy jako environmentalismus, mír a sociální spravedlnost.