* 1567: Po smrti svého manžela lorda Darnleyho a sňatku s hrabětem z Bothwellu byla Marie donucena vzdát se skotského trůnu a uvězněna na zámku Lochleven .
* 1568: Unikla z hradu Lochleven, ale byla poražena v bitvě u Langside a utekla do Anglie, kde byla vězněna po zbytek svého života. Původně byla držena na zámku Carlisle.
* 1568-1572: Byla přemístěna na hrad Bolton a poté na hrad Sheffield.
* 1572-1587: Mary byla přemístěna na hrad Tutbury, Wingfield Manor, Coventry, Chatsworth House a nakonec na hrad Fotheringhay, kde byla souzena a popravena v roce 1587.
Je důležité poznamenat, že nebyla vždy držena v drsných podmínkách. Některá z jejích uvěznění byla pohodlnější než jiná, v závislosti na místě a politickém klimatu. Vždy však byla pod přísnou ostrahou a svobodu už nikdy nezískala.