Existují také limity na počet určitých karet, které můžete mít ve svém balíčku:
* Hlavní paluba: Můžete mít pouze 3 kopie jakékoli konkrétní karty ve vašem hlavním balíčku, kromě základních monster, která nemají žádný limit (jako „Elemental HERO Shadow Mist“).
* Další balíček: Počet karet Extra Deck, které můžete mít, se liší v závislosti na formátu. Například ve formátu „Master Duel“ můžete mít 15 karet ve vašem Extra balíčku, zatímco formát "TCG" umožňuje 15 karet v Extra palubě.
Pamatujte, že v extra balíčku nemůžete mít více než jednu kopii karty.