* Tón: Gravity Falls je odlehčenější a komediální série, zatímco Mystery Incorporated je temnější a vážnější. Gravity Falls často obsahuje groteskní komedii a humor založený na slovních hříčkách, zatímco Mystery Incorporated je napínavější a sází spíše na humor s hororovou tématikou.
* Postavy: Postavy v Gravity Falls jsou výstřednější a svéráznější, zatímco postavy v Mystery Incorporated jsou realističtější a lze s nimi komunikovat. Postavy z Gravity Falls se s větší pravděpodobností dostanou do šílených situací a mají zvláštní schopnosti, zatímco postavy z Mystery Incorporated se s větší pravděpodobností zapojí do vážného vyšetřování a čelí skutečnému nebezpečí.
* Nastavení: Gravity Falls se odehrává v malém izolovaném městečku v Oregonu, zatímco Mystery Incorporated se odehrává ve fiktivním městě Crystal Cove v Kalifornii. Gravity Falls je více nadpřirozené prostředí, kde se pravidelně vyskytují podivná stvoření a události, zatímco Crystal Cove je normálnější prostředí, kde jsou záhady obvykle způsobeny lidskými zločinci.
* Formát: Gravity Falls je serializovaná série, kde každá epizoda navazuje na předchozí epizody a vede k většímu zastřešujícímu příběhu. Mystery Incorporated je více epizodické, přičemž každá epizoda je samostatný příběh.
Celkově vzato jsou Gravity Falls a Scooby-Doo Mystery Incorporated vynikající animované mysteriózní komedie, ale mají různé silné a slabé stránky. Gravity Falls je odlehčenější a komediálnější série s excentričtějšími postavami, zatímco Mystery Incorporated je temnější a vážnější série s realističtějšími postavami.