Zesilovače:Jedná se o sekvence DNA, které vážou transkripční faktory a podporují transkripci blízkých genů. Například enhancer v lokusu těžkého řetězce imunoglobulinu je zodpovědný za vysokou úroveň exprese těchto genů v B buňkách.
Promotory:Jsou to sekvence DNA, které vážou RNA polymerázu a iniciují transkripci genů. Například promotor v genu lidského růstového hormonu je zodpovědný za expresi tohoto genu v hypofýze.
Tlumiče:Jsou to sekvence DNA, které vážou transkripční faktory a potlačují transkripci blízkých genů. Například tlumič v lidském genu β-globinu je zodpovědný za represi tohoto genu v neerytroidních buňkách.
Transakční sekvence:
Transkripční faktory:Jsou to proteiny, které se vážou na cis-působící sekvence a regulují transkripci genů. Například transkripční faktor Oct-1 se váže na oktamerový motiv v zesilovači těžkého řetězce imunoglobulinu a podporuje transkripci těchto genů v B buňkách.
RNA polymeráza:Jedná se o proteinový komplex, který se váže na promotory a přepisuje geny do RNA.
Další regulační proteiny:Jsou to proteiny, které se vážou na cis-působící sekvence a regulují transkripci genů různými způsoby. Například protein CTCF se váže na motiv CCCTC v genu lidského β-globinu a pomáhá organizovat chromatinovou strukturu této oblasti, což je nezbytné pro represi genu v neerytroidních buňkách.