Co je Jacobsenův index?

Jacobsenův index fylogenetického stromu je mírou jeho rozvětvenosti neboli stupně, do kterého strom obsahuje krátké vnitřní větve. Je definována jako poměr celkové délky stromu (součet délek všech větví stromu) k minimální možné délce stromu, což je délka stromu se stejným počtem taxonů a bez vnitřních větví ( všechny taxony jsou spojeny přímo s kořenem).

Vysoký Jacobsenův index označuje strom s mnoha krátkými vnitřními větvemi, což může být důsledkem rychlé radiace taxonů nebo vysoké rychlosti vývoje charakteru. Nízký Jacobsenův index označuje strom s několika krátkými vnitřními větvemi, což může být důsledkem pomalé radiace taxonů nebo nízké rychlosti vývoje charakteru.

Jacobsenův index se často používá k porovnání relativní rozvětvenosti různých fylogenetických stromů a lze jej použít k posouzení přizpůsobení různých evolučních modelů danému souboru dat.