Gysiho nejdůležitějším dílem byla jeho kniha _Die Artikulation des Unterkiefers_ (1908), ve kterém popsal své studie anatomie a funkce temporomandibulárního kloubu. Vyvinul také několik nástrojů a technik pro měření okluze a artikulace, včetně Gysi Simplex Articulator .
Gysiho dílo mělo hluboký dopad na rozvoj stomatologie a je považován za jednoho z otců moderní okluze a artikulace.
Zde je seznam některých nejvýznamnějších děl Alfreda Gysiho:
* _Anatomie der Kaumuskulatur_ (1897)
*_Die Artikulation des Unterkiefers_ (1908)
* _Problém artikulace_ (1910)
* _Učebnice protetické stomatologie_ (1915)
* _Studies on the Mandibular Joint_ (1929)
* _Der Kauapparat des Menschen_ (1940)
Gysiho práce byla přeložena do mnoha jazyků a za svůj přínos v oblasti stomatologie získal řadu ocenění a vyznamenání. Je považován za jednu z nejvýznamnějších osobností v historii stomatologie.