- Jezte, pijte a buďte zdraví:Průvodce Harvard Medical School pro zdravé stravování (2001)
- Nutriční epidemiologie, 3. vydání (2013) (ve spolupráci s Meirem Stampferem)
- Willettova nutriční epidemiologie, druhé vydání (2018) (editoval Willett)
- The Salt Sugar Fat Fix:How the Food Giants Hooked Us (2020) (ve spolupráci s Marion Nestlé)
Kromě těchto knih Walter Willett publikoval vědecké články, recenze a politická doporučení v různých lékařských a nutričních časopisech.