Román je psán z pohledu Bruna, devítiletého německého chlapce, který si neuvědomuje skutečnou povahu otcovy práce a zvěrstev spáchaných v koncentračním táboře sousedícím s jejich domovem. Brunovýma očima jsou čtenáři svědky ostrého kontrastu mezi privilegovaným životem, který vede, a drsnou realitou, které čelí Shmuel a další vězni tábora.
Boyneovo vykreslení postav zdůrazňuje destruktivní dopady války a předsudků jak na jednotlivce, tak na společnost. Brunova proměna z naivního dítěte v někoho, kdo začíná zpochybňovat svět kolem sebe, zdůrazňuje důležitost vzdělání a empatie v boji proti nenávisti a netoleranci. Přátelství mezi Brunem a Shmuelem, navzdory překážkám, které jim jejich okolnosti kladou, slouží jako mocný symbol odolnosti lidského ducha i tváří v tvář nepředstavitelnému utrpení.
Navíc Boyneovo použití jednoduchého jazyka a přímočarého vyprávění umožňuje, aby závažnost událostí hluboce rezonovala u čtenářů, mladých i starých. Tím, že ukazuje hrůzy holocaustu optikou dětské perspektivy, zprostředkovává hluboký dopad těchto událostí, aniž by se uchyloval ke grafickým popisům. Tento přístup podtrhuje univerzální poselství, že válka a nesnášenlivost jsou zničující síly, kterým je třeba čelit a které je třeba odstranit.
Celkově „Chlapec v pruhovaném pyžamu“ slouží jako drásavá připomínka důsledků nekontrolovaných předsudků a nenávisti a mocně obhajuje mír, toleranci a porozumění mezi lidmi z různých prostředí.