* Nebezpečí arogance: Pokus bratrů Elricových použít alchymii k oživení své matky vede k jejich vlastnímu zmrzačení, zdůraznění potenciálních nebezpečí nekontrolovaných ambicí a honby za poznáním, aniž by pochopili jeho plné důsledky.
* Hledání pravdy: Série zkoumá povahu pravdy a to, jak může být zkreslena nebo manipulována, zejména v kontextu armády a programu Státní alchymista.
* Význam lidského spojení a empatie: Série zdůrazňuje hodnotu lidských vztahů a to, jak mohou jednotlivcům pomoci orientovat se ve složitosti jejich vlastních zkušeností. To je evidentní v silných poutech mezi bratry Elricovými, stejně jako v různých vztazích, které navazují během své cesty.
* Etické důsledky vědeckého pokroku: Fullmetal Alchemist se potýká s etickými dilematy, které představují výkonné technologie, jako je alchymie, a potenciál zneužití. Povzbuzuje publikum, aby zvážilo odpovědnost, která přichází se znalostmi a jejich aplikacemi.
Série nakonec naznačuje, že i když je honba za poznáním cenná, musí být vyvážena moudrostí, empatií a hlubokým pochopením jejího potenciálního dopadu na svět a lidi kolem nás.