Tvar: Zobcová flétna je poměrně jednoduchý nástroj s rovným tělem a malým náustkem. Naproti tomu flétna má složitější tvar se zakřiveným hlavovým kloubem, tělem s klíči a otvory a nožním kloubem.
Zvuk: Zvuk zobcové flétny je typicky měkký a jemný, zatímco zvuk flétny je jasnější a pronikavější. To je způsobeno různými způsoby hry na nástroje. Na zobcovou flétnu se hraje foukáním vzduchu do náústku, zatímco na flétnu se hraje foukáním vzduchu přes otvor v hlavovém kloubu.
Rozsah: Zobcová flétna má omezený rozsah asi dvou oktáv, zatímco flétna má širší rozsah asi tři oktávy. To znamená, že flétna může hrát vyšší a nižší tóny než zobcová flétna.
Technika: Zobcová flétna je poměrně snadno naučitelný nástroj, zatímco flétna je obtížnější. Je to proto, že flétna vyžaduje přesnější nátisk (způsob, jakým jsou umístěny rty a ústa hráče) a větší koordinaci mezi prsty a dechem.
Repertoár: Zobcová flétna má velký repertoár hudby, která byla napsána speciálně pro nástroj. Velký repertoár má i flétna, ale zahrnuje i hudbu, která byla původně napsána pro jiné nástroje, jako jsou housle nebo klavír.
Celkově jsou zobcová flétna a flétna dva různé nástroje s různými zvuky, rozsahy, technikami a repertoáry.