Juanes je také známý tím, že používá kytary Gibson a Fender, stejně jako na zakázku vyrobené nástroje od různých houslařů.
Zde jsou některé kytary, které Juanes používal:
* Martin D-28:Toto je Juanesova hlavní akustická kytara a použil ji na mnoha nahrávkách a vystoupeních. D-28 je kytara ve stylu dreadnought s masivní deskou ze smrku Sitka a mahagonovou zadní stranou a boky. Je známý pro svůj teplý, plný zvuk.
* Martin D-45:Toto je dražší a limitovaná edice D-28, která má pevnou vrchní desku ze smrku Adirondack a záda a boky z růžového dřeva.
* Martin OM-28:Toto je kytara s menším tělem než D-28 a D-45, s jemnějším zvukem. Dobře se hodí pro fingerpicking a brnkání.
* Gibson J-45:Jedná se o klasickou akustickou kytaru od společnosti Gibson s masivní smrkovou deskou Sitka a mahagonovou zadní stranou a boky. J-45 má teplý, průrazný zvuk, který je ideální pro rytmické hraní.
* Fender Stratocaster:Jedná se o klasickou elektrickou kytaru od Fenderu s masivním olšovým tělem, javorovým krkem a třemi snímači s jednou cívkou. Stratocaster je známý pro svůj jasný, napjatý zvuk.
Juanes je vysoce zručný kytarista a dokáže ze svých kytar dostat širokou škálu zvuků. Je mistrem jak na akustickou, tak na elektrickou kytaru a stejně pohodlně hraje sólovku a rytmus.