- 2007 MTV Europe Music Awards:Nejlepší rock
- 2010 MTV Video Music Awards:Nejlepší alternativní video ("Kings and Queens")
- 2011 MTV Video Music Awards:Nejlepší rockové video ("Closer to the Edge")
- 2013 MTV Video Music Awards:Nejlepší alternativní video ("Up in the Air")
- 2014 Billboard Music Awards:Nejlepší rocková píseň ("Up in the Air")
- 2015 iHeartRadio Music Awards:Nejlepší alternativní rocková píseň roku ("Walk on Water")
- 2017 Alternative Press Music Awards:Nejlepší živá kapela
- 2018 Lo Nuestro Awards:Pop/Rock Song of the Year ("Rescue Me")
Kromě těchto cen bylo 30 Seconds to Mars nominováno také na řadu dalších cen, včetně cen Grammy a Brit Awards.