Počáteční kariéra:
* Breaking the Waves (1996): Její průlomová role jí vynesla nominaci na Oscara za nejlepší herečku.
* Hilary a Jackie (1998): Ztvárnila brilantní, ale problémovou houslistku Jacqueline du Pré.
* The Boxer (1997): Romantické drama odehrávající se v Severním Irsku.
* Angela's Ashes (1999): Hrála matku v této adaptaci memoárů Franka McCourta.
Pozdější kariéra:
* Red Dragon (2002): Thriller podle románu Thomase Harrise.
* Život a smrt Petera Sellerse (2004): Hrála manželku Petera Sellerse.
* Válka světů (2005): Sci-fi film s Tomem Cruisem v hlavní roli.
* Dívka v kavárně (2005): Politické drama odehrávající se v Bruselu.
* Tajný život včel (2008): Drama o mladé dívce, která utíká za svou matkou.
* Zlodějka knih (2013): Historické drama o mladé dívce v nacistickém Německu.
* Everest (2015): Hrál roli Helen Wilton.
* The Lighthouse (2019): Psychologický horor s Willemem Dafoem.
* Elektrický život Louise Waina (2021): Hrál roli Emily Richardson.
* The King's Man (2021): Prequel k filmové sérii Kingsman.
Další významné filmy:
* The Escapist (2008): Kriminální drama.
* Anna Karenina (2012): Filmová adaptace románu Lva Tolstého.
* Můj týden s Marilyn (2011): Životopisné drama o Marilyn Monroe.
* Ztracená dcera (2021): Psychologické drama s Olivií Colmanovou v hlavní roli.
Toto je jen ukázka z působivé filmografie Emily Watsonové. I nadále je aktivní a uznávanou herečkou a má za sebou mnoho dalších projektů.