Hra se zaměřuje na chytání Shadow Pokémonů a jejich vrácení do původní podoby ne na tradiční čištění.
Postup funguje takto:
1. Chyťte Shadow Pokémona: Ve hře narazíte na Shadow Pokémony a musíte je chytit pomocí „Snag Machine“.
2. Trénujte a vytvářejte pouto: Trénujete své Shadow Pokémony a budujete s nimi pouto. To se děje prostřednictvím bojů a používání předmětů.
3. Očistěte pomocí Čistící koule: Jakmile Shadow Pokémon dosáhne dostatečně vysoké úrovně vazby, můžete použít Purify Orb obnovit jejich pravou podobu. To odstraní temnou auru Shadow Pokémona a obnoví jejich původní statistiky a vzhled.
Takže místo „očištění“ Pokémonů v podstatě osvobodíte je z jejich stínové podoby .