Španělská armáda byla masivní flotila lodí, které vyslal španělský král Filip II. na invazi do Anglie v roce 1588. Drake byl jedním z velitelů anglické flotily, která Armadu porazila.
2. portugalské námořnictvo
Portugalské námořnictvo bylo další velkou hrozbou pro Drakeovy výpravy. Portugalsko bylo v té době mocnou námořní velmocí a jeho námořnictvo bylo dobře vybavené a dobře vycvičené. Drake měl několik střetnutí s portugalským námořnictvem a byl často v přesile a přestřelce.
3. Domorodí Američané
Drake se také musel potýkat s domorodými Američany, kteří žili v oblastech, které prozkoumal. Domorodí Američané se k Angličanům často chovali nepřátelsky a ti občas zaútočili na Drakeovy lodě.
4. Počasí
Drake se musel vypořádat i s počasím. Moře kolem Jižní Ameriky mohou být velmi rozbouřené a Drakeovy lodě často zastihly bouře.
5. nemoc
Nemoc byla neustálou hrozbou pro Drakea a jeho posádku. Mnoho nemocí, které byly běžné v tropech, bylo smrtelných a Drake kvůli nemoci ztratil mnoho mužů.
6. Vzpoura
V roce 1578 se Drakeova posádka proti němu vzbouřila. Vzpouru vedl Thomas Doughty, který byl Drakeovým zástupcem ve velení. Doughty byl nakonec popraven a vzpoura byla potlačena.
Přes všechny tyto překážky byl Drake schopen dokončit své obeplutí světa. Byl zručným navigátorem a odvážným průzkumníkem a je považován za jednoho z největších mořeplavců v historii.