Bach byl oddaný luterán a jeho víra ovlivnila jeho hudbu. Mnoho z jeho děl je založeno na biblických příbězích nebo textech, včetně Matoušových pašijí, Svatojanských pašijí a Vánočního oratoria.
Další skladatelé
Bacha ovlivnili i další skladatelé, včetně jeho vlastních příbuzných (zejména jeho strýc Johann Christoph Bach a bratranec jeho otce Johann Jakob Bach). Studoval hudbu mnoha dalších skladatelů, včetně Palestriny, Tallise, Byrda, Frescobaldiho, Buxtehuda a Vivaldiho.
Svět přírody
Bach se také inspiroval přírodou. Mnoho z jeho děl obsahuje pohyby, které evokují zvuky ptáků, zvířat a dalších přírodních jevů. Například „Sinfonia“ z jeho Kantáty č. 215 zobrazuje bouři, zatímco „Vzduch“ z jeho Orchestrální suity č. 3 napodobuje píseň slavíka.
Osobní zkušenosti
Bachovy osobní zkušenosti ovlivnily i jeho hudbu. Předpokládá se například, že smrt jeho první manželky Marie Barbory inspirovala „Krucifixa“ z jeho mše h moll.
Touha vytvářet krásu
Bacha inspirovala především touha tvořit krásnou hudbu. Věřil, že hudba je dar od Boha, a byl odhodlán využít svůj talent k vytvoření hudby, která by oslavovala Boha a povznesla lidského ducha.